Vijf jaar na hun 'uitstekende' avontuur door de tijd wil het Bill en Ted nog steeds niet echt lukken in de muziek wereld. Ze spelen nog steeds slecht en worden puur uit 'medelij' toegelaten in het toernooi waarmee ze volgens Rufus bekend zouden moeten worden, de wereld veranderen en stuff

.
In de toekomst wordt Rufus overvallen tijdens een college door een oud leraar van hem DeNomolos. Deze is de 27e eeuw meer dan zat, hij kan de ideeën en muziek van Bill en Ted niet meer aanhoren en wil er een eind aanmaken.
Hij heeft hiervoor twee robots gemaakt in het evenbeeld van Bill en Ted. Deze stuurt hij terug naar het verleden om de echte Bill en Ted te vermoorden en het toernooi te verzieken. Als dit lukt zal hij toekomst kunnen hervormen naar zijn eigen ideeën.
Zo gezegd zo gedaan de Evil Bill en Ted gaan terug en weten binnen niet al te veel tijd Bill en Ted te vermoorden. Deze geven echter niet zo heel snel op en weten de magere Hein te ontlopen en gaan terug naar hun flat.
Aldaar ontdekken ze dat Evil Bill en Ted hun leven hebben overgenomen en tevens van plan zijn hun middeleeuwse vriendinnen te vermoorden. Dit willen ze natuurlijk voorkomen maar het probleem is dat niemand hen ziet of kan horen. Ze besluiten dan maar hun 'geesten' krachten te gebruiken om mensen te proberen waarschuwen. Dit loopt echter fout wanneer ze de seance van Ted's stiefmoeder verstoren. Deze weet hen namelijk naar de Hel te 'verbannen'.
Nu moeten ze dus eerst weer uit de hel zien te geraken, tevens weer levend zien te worden. Dit is echter nog niet zo makkelijk want de enige mannier om dit voor elkaar te krijgen is om Magere Hein uit te dagen in een spel. Maar deze heeft nog nooit verloren!